كمبيوتر Eni الفائق HPC5 لمكافحة فيروس كورونا: تجربة الحوسبة الجزيئية الفائقة الأكثر تعقيدًا التي تم إجراؤها على الإطلاق في العالم
تم إطلاق البنية التحتية للحوسبة الفائقة HPC5 من Eni ليلة الجمعة 20 نوفمبر ، وهي تجربة الحوسبة الجزيئية العملاقة الأكثر تعقيدًا التي تم إجراؤها على الإطلاق في العالم من أجل تحديد علاجات جديدة ضد الفيروس.
التجربة ، التي أُجريت في مركز البيانات الخضراء لشركة إيني في فيريرا إيربوجنون ، هي محاكاة أتاحت اختبار 70 مليار جزيء في 15 "موقعًا نشطًا" للفيروس من خلال معالجة ألف مليار تفاعل في 60 ساعة فقط. ، أو 5 ملايين عملية محاكاة في الثانية.
HPC5 ، أقوى حاسوب عملاق صناعي في العالم ، هو أحد الموارد التي نشرتها إيني تلقائيًا كجزء من خطة عمل واسعة وضعتها الشركة لمكافحة الوباء. تم توفير قوة الحوسبة العالية جدًا ، المرتبطة بالمهارات الداخلية في مجال النمذجة الجزيئية ، في المرحلة الثانية من المشروع الأوروبي EXSCALATE4CoV ، وهو اتحاد ملتزم بتحديد الأدوية الجديدة الأكثر أمانًا والواعدة في مكافحة فيروس كورونا. يتم التخطيط لمرحلة لاحقة من التجارب يتم خلالها تعميق دراسة فعالية الجزيئات في حالة حدوث طفرة فيروسية.
يقود المشروع شركة الأدوية البيولوجية الإيطالية Dompé التي تجمع لهذا الغرض ثمانية عشر شريكًا من المؤسسات ومراكز البحوث المتميزة من سبع دول أوروبية ، بما في ذلك Cineca di Bologna.
تم إجراء تجربة الحوسبة الفائقة التي أجرتها HPC5 أيضًا بالتعاون مع المكتبة الجزيئية EXSCALATE4CoV ، والحاسوب الفائق Marconi100 من Cineca ، وبرنامج الفحص الافتراضي الذي تم تسريعها بواسطة Politecnico di Milano ، وتحليلات SAS ، وتمثل المرحلة الثانية من المشروع .
كانت النتيجة الرئيسية للمرحلة الأولى التي شارك فيها HPC5 هي تحديد جزيء Raloxifene ، وهو جزيء معروف ثبت أنه فعال في المختبر ضد فيروس SARS-CoV-2 في مواجهة تكاثره في الخلايا. في 27 أكتوبر 2020 ، أجاز AIFA الدراسة السريرية في مستشفى Spallanzani في روما و Humanitas في ميلانو لتقييم عقار رالوكسيفين كعلاج محتمل لمرضى كوفيد.