Eni HPC5 superkompjuter za borbu protiv koronavirusa: najsloženiji eksperiment molekularnog superkompjutera ikada izveden u svijetu
Eni-jeva HPC5 superkompjuterska infrastruktura počela je u noći na petak 20. novembra najkompleksniji eksperiment molekularnog superkompjutera ikada izveden u svijetu kako bi se identificirale nove terapije protiv virusa.
Eksperiment, koji se odvijao u Eni Green Data Centru u Ferrera Erbognone, simulacija je koja je omogućila da se 70 milijardi molekula testira na 15 "aktivnih mjesta" virusa kroz obradu od triliona interakcija u samo 60 sati, odnosno 5 milion simulacija u sekundi.
HPC5, najmoćniji industrijski superkompjuter na svijetu, jedan je od resursa koje Eni spontano koristi kao dio širokog akcionog plana koji je kompanija razvila za borbu protiv pandemije. Vrlo velika računarska snaga, povezana s internim vještinama u području molekularnog modeliranja, stavljena je na raspolaganje u drugoj fazi europskog projekta EXSCALATE4CoV, konzorcija posvećenog identifikaciji najsigurnijih i najperspektivnijih novih lijekova u borbi protiv koronavirusa. Planirana je naredna faza testiranja tokom koje će se detaljnije proučavati efikasnost molekula u slučaju mutacije virusa.
Projekat vodi italijanska biofarmaceutska kompanija Dompé koja u tu svrhu okuplja osamnaest partnera uključujući institucije i istraživačke centre izvrsnosti iz sedam evropskih zemalja, uključujući Cineca of Bologna.
Eksperiment superkompjutera koji je sproveo HPC5 takođe se odvijao uz saradnju molekularne biblioteke EXSCALATE4CoV, superkompjutera Marconi100 iz Cineca i softvera za virtuelni skrining koji je ubrzala Politehnika u Milanu i analitiku SAS-a i predstavlja drugu fazu projekta. .
Glavni rezultat prve faze u kojoj je bio uključen HPC5 bila je identifikacija raloksifena, poznatog molekula koji se pokazao djelotvornim in vitro protiv virusa SARS-CoV-2 u suzbijanju njegove replikacije u stanicama. Dana 27. oktobra 2020. AIFA je odobrila kliničku studiju u bolnici Spallanzani u Rimu i Humanitas u Milanu kako bi se raloksifen procijenio kao potencijalni tretman za pacijente s Covidom.