ابر رایانه HPC5 انی برای مبارزه با ویروس کرونا: پیچیده ترین آزمایش ابر رایانه مولکولی که تاکنون در جهان انجام شده است
زیرساخت ابر رایانه HPC5 انی در شب جمعه 20 نوامبر پیچیده ترین آزمایش ابر رایانه مولکولی تاکنون در جهان به منظور شناسایی روش های درمانی جدید علیه ویروس آغاز شده است.
این آزمایش که در مرکز داده های سبز Eni در Ferrara Erbognone انجام شد ، یک شبیه سازی است که امکان آزمایش 70 میلیارد مولکول در 15 "سایت فعال" ویروس را از طریق پردازش هزار میلیارد فعل و انفعالات فقط در 60 ساعت فراهم می کند. ، یا 5 میلیون شبیه سازی در ثانیه.
HPC5 ، قدرتمندترین ابر رایانه صنعتی در جهان ، یکی از منابعی است که به طور خودجوش توسط Eni به عنوان بخشی از برنامه عملیاتی گسترده ای که توسط این شرکت برای مقابله با بیماری همه گیر تهیه شده است ، به کار گرفته می شود. قدرت محاسباتی بسیار بالا ، همراه با مهارت های داخلی در زمینه مدل سازی مولکولی ، در مرحله دوم پروژه اروپایی EXSCALATE4CoV ، کنسرسیومی متعهد به شناسایی ایمن ترین و امیدوار کننده ترین داروهای جدید در مبارزه با ویروس کرونا در دسترس قرار گرفت. مرحله بعدی آزمایش پیش بینی شده است که طی آن مطالعه در مورد اثربخشی مولکولها در صورت جهش ویروس تعمیق می یابد.
این پروژه توسط شرکت داروسازی ایتالیایی Dompé هدایت می شود که برای این منظور هجده شریک از موسسات و مراکز تحقیقاتی عالی از هفت کشور اروپایی از جمله Cineca di Bologna را گرد هم آورده است.
آزمایش ابررایانه انجام شده توسط HPC5 همچنین با همکاری کتابخانه مولکولی EXSCALATE4CoV ، ابر رایانه Marconi100 Cineca و نرم افزار غربالگری مجازی که توسط Politecnico di Milano و تجزیه و تحلیل SAS تسریع شده است ، انجام می شود و فاز دوم پروژه را نشان می دهد. .
نتیجه اصلی مرحله اول که HPC5 در آن نقش داشت شناسایی رالوکسیفن بود ، یک مولکول شناخته شده که نشان داده شده است در شرایط in vitro علیه ویروس SARS-CoV-2 در خنثی سازی تکثیر آن در سلول ها موثر است. در 27 اکتبر سال 2020 ، AIFA مجوز مطالعه بالینی را در بیمارستان Spallanzani در رم و Humanitas در میلان برای ارزیابی رالوکسیفن به عنوان یک درمان بالقوه برای بیماران Covid صادر کرد.