Le supercalculateur HPC5 d'Eni pour la lutte contre le coronavirus: l'expérience de supercalcul moléculaire la plus complexe jamais réalisée au monde
L'infrastructure de superinformatique HPC5 d'Eni a lancé dans la nuit du vendredi 20 novembre l'expérience de superinformatique moléculaire la plus complexe jamais réalisée au monde afin d'identifier de nouvelles thérapies contre le virus.
L'expérience, qui a eu lieu dans le Green Data Center d'Eni à Ferrera Erbognone, est une simulation qui a permis de tester 70 milliards de molécules sur 15 «sites actifs» du virus grâce au traitement de mille milliards d'interactions en seulement 60 heures , soit 5 millions de simulations par seconde.
HPC5, le supercalculateur industriel le plus puissant au monde, est l'une des ressources spontanément déployées par Eni dans le cadre d'un vaste plan d'action élaboré par l'entreprise pour lutter contre la pandémie. La très haute puissance de calcul, associée à des compétences internes dans le domaine de la modélisation moléculaire, a été mise à disposition dans la deuxième phase du projet européen EXSCALATE4CoV, un consortium engagé dans l'identification des nouveaux médicaments les plus sûrs et les plus prometteurs dans la lutte contre le Coronavirus. Une phase ultérieure d'expérimentation est prévue au cours de laquelle l'étude sur l'efficacité des molécules en cas de mutation virale sera approfondie.
Le projet est mené par la société biopharmaceutique italienne Dompé qui, à cet effet, rassemble dix-huit partenaires d'institutions et de centres de recherche d'excellence de sept pays européens, dont Cineca di Bologna.
L'expérience de superinformatique menée par HPC5 a également eu lieu avec la collaboration de la bibliothèque moléculaire EXSCALATE4CoV, le supercalculateur Marconi100 de Cineca, et le logiciel de criblage virtuel accéléré par le Politecnico di Milano, et l'analyse de SAS, et représente la deuxième phase du projet .
Le principal résultat de la première phase dans laquelle HPC5 a été impliqué a été l'identification du raloxifène, une molécule connue qui s'est avérée efficace in vitro contre le virus SARS-CoV-2 pour contrer sa réplication dans les cellules. Le 27 octobre 2020, l'AIFA a autorisé l'étude clinique à l'hôpital Spallanzani à Rome et à Humanitas à Milan pour évaluer le raloxifène en tant que traitement potentiel pour les patients Covid.