Les bactéries lactiques jouent un rôle fondamental dans l'axe microbiome alimentaire-intestinal. Les aliments sont la principale source de bactéries lactiques pour l'intestin, selon une étude de leurs génomes publiée dans Nature Communications.
Le microbiome intestinal est un ensemble complexe de micro-organismes qui fonctionne dans nos intestins et joue un rôle fondamental dans notre santé.
Le fonctionnement du microbiome intestinal peut être aidé par des micro-organismes probiotiques, dont beaucoup sont des bactéries lactiques.
En plus d'être disponibles sous forme de suppléments, les bactéries lactiques probiotiques peuvent également être prises avec certaines catégories d'aliments.
Combien et laquelle de ces bactéries font alors partie du microbiome intestinal affectant potentiellement la santé humaine? C'est la question à laquelle répond l'étude récemment publiée.
L'empreinte digitale d'un micro-organisme est son ADN, son génome. En analysant des centaines de milliers de génomes de bactéries lactiques trouvés dans des échantillons alimentaires et intestinaux humains du monde entier, les chercheurs ont découvert que les bactéries lactiques alimentaires sont si similaires à celles trouvées dans l'intestin humain qu'il est prudent de spéculer. que la principale source de ces bactéries pour les humains sont des aliments comme le yogourt et le fromage. De ce point de vue, les aliments fermentés riches en bactéries lactiques peuvent également être considérés comme «potentiellement et naturellement fonctionnels».
Les bactéries lactiques (également appelées ferments lactiques dans le langage le plus courant) sont parmi les micro-organismes les plus étudiés. Ils sont chargés d'obtenir par fermentation de nombreux aliments tels que les yaourts, les fromages, les produits de boulangerie traditionnels au levain, les viandes fermentées ou les produits végétaux. Les processus de fermentation sont étudiés depuis plus d'un siècle ou depuis le début de la pratique de la fermentation des aliments comme stratégie de stockage du lait, de la viande et des légumes. Le rôle des bactéries lactiques est de transformer les matières premières, et de contribuer par leurs activités métaboliques aux caractéristiques rhéologiques et sensorielles de l'aliment. En d'autres termes, il n'y aurait ni yogourt ni fromage sans l'action de ces micro-organismes importants.
De nombreuses souches appartenant à des espèces de bactéries lactiques sont également étudiées et commercialisées en tant que probiotiques, genre Lactobacillus. Les probiotiques font l'objet d'un intérêt considérable en raison de leur potentiel à ajouter des propriétés fonctionnelles à certains aliments ou à leur utilisation comme compléments alimentaires à des fins différentes.
La bonne nouvelle est que la majorité des aliments fermentés contiennent plusieurs milliers (souvent des centaines de milliers) de bactéries lactiques vivantes qui sont ensuite ingérées au moment de consommation de yaourt, fromages, etc.. Certains d'entre eux peuvent contenir des bactéries probiotiques naturellement présentes dans les matières premières ou sélectionnées lors de la production alimentaire. Par conséquent, de nombreux aliments fermentés pourraient être "naturellement fonctionnel«Parce qu'ils contiennent des niveaux élevés de bactéries lactiques, certains de ces probiotiques sont potentiellement.
Une fois les barrières gastriques surmontées, combien de ces microorganismes atteignent l'intestin? Et combien rejoignent la grande communauté du microbiome intestinal?
Certains chercheurs appartenant au groupe de recherche du professeur Ercolini du département d'agriculture et au groupe de travail universitaire pour les études sur le microbiome, en collaboration avec d'autres partenaires européens, comme Teagasc (Agriculture and Food Development Authority, Irlande) et CIBIO de l'Université de Trente, ont analysé des centaines de milliers de génomes pour tenter de répondre à ces questions. L'étude a été menée dans le cadre du projet MASTER (Microbiome Applications for Sustainable Food Systems through Technologies and Enterprise), l'un des principaux financements de l'UE pour les études sur le microbiome d'Horizon 2020 (www.master-h2020.eu).
Grâce à des algorithmes modernes d'analyse informatique, les génomes des bactéries lactiques ont été reconstruits à partir d'environ 300 aliments et près de 10.000 XNUMX échantillons biologiques humains provenant de différents continents, vérifiant la distribution des bactéries lactiques en fonction de l'origine géographique, de l'âge et du mode de vie. des sujets impliqués. En général, les chercheurs ont trouvé une prévalence variable, en fonction du niveau d'occidentalisation du mode de vie, et une abondance relative assez faible de bactéries lactiques chez l'homme, en particulier par rapport aux niveaux plus élevés d'autres membres du microbiome intestinal. Les bactéries lactiques les plus fréquemment rencontrées sont Streptococcus thermophilus et Lactococcus lactis, très répandus dans les yaourts et les fromages.
Environ 3000 génomes de bactéries lactiques ont également été comparés: le niveau élevé de similitude des génomes de bactéries lactiques provenant de l'alimentation et de l'homme suggère qu'en réalité la consommation d'aliments riches en bactéries lactiques peut enrichir nos intestins en microorganismes potentiellement probiotiques.
L'étude, qui vient d'être publiée dans Nature Communications (https://doi.org/10.1038/s41467-020-16438-8) peuvent ouvrir de nouveaux horizons d'étude sur les aliments fermentés comme potentiellement fonctionnels. En outre, la recherche propose des idées et des méthodologies pour le développement de stratégies appropriées et modernes pour vérifier l'efficacité des bactéries probiotiques par rapport à leur capacité à s'associer de manière stable au microbiome intestinal humain.