Superpočítač Eni HPC5 pre boj proti koronavírusom: najkomplexnejší molekulárny superpočítačový experiment, aký sa kedy na svete uskutočnil

Eniho superpočítačová infraštruktúra HPC5 spustila v piatok 20. novembra najkomplexnejší experiment s molekulárnymi superpočítačmi, aký sa kedy na svete uskutočnil, s cieľom identifikovať nové terapie proti vírusu.

Experiment, ktorý sa uskutočnil v Eniho zelenom dátovom centre vo Ferrere Erbognone, je simuláciou, ktorá umožnila testovať 70 miliárd molekúl na 15 „aktívnych miestach“ vírusu prostredníctvom spracovania tisíc miliárd interakcií za pouhých 60 hodín. alebo 5 miliónov simulácií za sekundu.

HPC5, najsilnejší priemyselný superpočítač na svete, je jedným zo zdrojov, ktoré spoločnosť Eni spontánne nasadila ako súčasť rozsiahleho akčného plánu vypracovaného spoločnosťou na boj proti pandémii. Veľmi vysoký výpočtový výkon spojený s internými schopnosťami v oblasti molekulárneho modelovania bol sprístupnený v druhej fáze európskeho projektu EXSCALATE4CoV, konzorcia, ktoré sa zaviazalo identifikovať najbezpečnejšie a najsľubnejšie nové lieky v boji proti koronavírusom. Očakáva sa následná fáza experimentovania, počas ktorej sa prehĺbi štúdia účinnosti molekúl v prípade mutácie vírusu.

Projekt vedie talianska biofarmaceutická spoločnosť Dompé, ktorá za týmto účelom združuje osemnásť partnerov z inštitúcií a výskumných centier excelentnosti zo siedmich európskych krajín vrátane Cineca di Bologna.

Superpočítačový experiment, ktorý uskutočnil HPC5, tiež prebiehal za spolupráce molekulárnej knižnice EXSCALATE4CoV, superpočítača Marconi100 od spoločnosti Cineca a virtuálneho skríningového softvéru akcelerovaného Politecnico di Milano a analytiky SAS a predstavuje druhú fázu projektu. .

Hlavným výsledkom prvej fázy, v ktorej bol zahrnutý HPC5, bola identifikácia raloxifénu, známej molekuly, o ktorej sa preukázalo, že je účinná in vitro proti vírusu SARS-CoV-2 pri pôsobení proti jeho replikácii v bunkách. 27. októbra 2020 AIFA povolila klinickú štúdiu v nemocnici Spallanzani v Ríme a Humanitas v Miláne, v ktorej sa hodnotila raloxifén ako potenciálna liečba pacientov s Covidom.

Eni: Superpočítač HPC5 na výskum nových liečebných postupov proti koronavírusom